实验室通风柜内放置装备或仪器时，其摆放位置会影响实验室通风柜内气流形态，当操作人员站在实验室通风柜前方时，会造成一股涡流，而此时如果操作人员前方物品置放位置不正确时，将会导致这种逆流及扰流的情形加重。
1、器材应尽量于靠实验室通风柜内部深处放置，并应至少距离调节门15至20厘米。
2、若因装备过长而将其伸出调节门外，或置放之位置足以影响调节门之开启或关闭。
3、当放置设备高度超过10厘米时，此设备下方需要有气流通道，可使用不锈钢支架将设备架高，中空型或孔状支架可以降低对气流形态之干扰。
4、应避免在实验室通风柜内置放过多的设备及仪器，在实验室通风柜内的装备或其它设备总面积不得超过台面板面积50%。
5、实验室通风柜内如须使用需用电源之设备或仪器时更应注意，该设备应接地，以降低火花产生的可能性。电源线应从下方进气口处拉出，外接电源插座，电源插座也应有完善及经过认证的接地设施。
6、柜内有产生高热负载设备，其热源将会造成柜内气流变化，影响实验室通风柜玻璃视窗开口下方的表面风速。热气流会增加玻璃视窗开口下方的表面风速，开口上半部的表面风速降低。
7、由于一般在实验室通风柜内的上方以及调节门的后方都会有逆流及涡流的存在，所以应尽量避免在这两个部位产生大量之气流扰动。